Projektu veica uzņēmums NOC ("Hellmuth, Obata & Kesselbaum"), ļoti veiksmīgas Nacionālā aeronautikas muzeja ēkas autori Vašingtonā. Linkolna muzeja dibinātāju mērķis bija izveidot kompleksu, kas iemūžina ne tikai lielās politiskās personas piemiņu, bet arī stāsta par viņa kā dzīvas personas dzīvi, nevis par Amerikas demokrātijas simbolu. Šim nolūkam, kā arī lai piesaistītu tur maksimālu jauniešu skaitu, ekspozīcijas lielākoties ir interaktīvas, tiek plaši izmantotas vēsturisko ainu rekonstrukcijas "vaska muzeja" garā.
Arhitektūras projekts tika "pielāgots" šādam saturam, vienlaikus neapšaubāmi cieta tā oriģinalitāte. Tajā pašā laikā, aplūkojot tās klasificētās formas, nevar nepamanīt līdzības ar tirdzniecības vai izklaides iestādēm, stilizētām "antīkām". Galvenais motīvs bija grieķu tholos templis: to kompozīcijā izmantoja trīs reizes: kā galveno ieeju, kā sapārotu apjomu, kas rada ieejas kompozīcijas izskatu, un ēkas centrā ievieto vēl vienu rotondu: tajā rekonstruēts Baltā nama interjers.
Pārējā kaļķakmens apšūtā muzeja ēka ir blāvi taisnstūrveida apjomi, kas atšķaidīti ar nevietā pseidoklasiskā ēkā, modernisma lentes logiem un Wright "prēriju māju" pastiprinātajām dzegām.
